Բացահայտման ճանապարհային քարտեզ

ՄԱԿ-ի գիտաշխատողը ղեկավարում է մարդու գենոմի միջազգային հետազոտությունը

Նոր ուսումնասիրությունը ցույց է տալիս, որ մարդու գենոմի գրեթե 40 տոկոսը հիմնականում մնում է չուսումնասիրված, ինչը կարող է կտրուկ խոչընդոտել դեղորայքային բուժման նոր մեթոդների որոնմանը:

Հետազոտությունների պակասը հակված է ինքնահաստատվելու, քանի որ գիտնականները գիտեն, որ ավելի հավանական է, որ հաջողակ լինեն և ֆինանսավորվեն գենոմի այն տարածքների հարցումներով, որոնք արդեն համեմատաբար լավ նկարագրված են:

Որպես խնդրի լուծման առաջին քայլ՝ ամերիկացի և եվրոպացի գիտնականների խումբն առաջարկել է գենոմը դասակարգելու էլեգանտ մեթոդ՝ ըստ գեների և դրանց ծածկագրման պրոտեինների լայնածավալ ուսումնասիրության: Դասակարգման նոր սխեման նաև առաջարկում է, թե ինչ քայլեր են անհրաժեշտ՝ պարզելու համար, թե արդյոք այդ սպիտակուցները հավանական թիրախներ են նոր դեղորայքային թերապիաների համար:

Աշխատանքն իրականացվել է Առողջապահության ազգային ինստիտուտների միասնական հիմնադրամի «Լուսավորող դեղորայքային գենոմը» (IDG) ծրագրի շրջանակներում: Գտածոները կարևորվում են «Չուսումնասիրված թերապևտիկ հնարավորություններ մարդու գենոմում,տպագրված 23 թվականի փետրվարի 2018-ի համարում Բնության ակնարկ Թմրամիջոցների բացահայտում.

«Գրեթե 9,000 սպիտակուցներ ներկայումս չեն ենթարկվում NIH-ի կողմից հովանավորվող հետազոտության», - ասում է առաջատար հեղինակ Թուդոր Օփրեան, բ.գ.թ., պրոֆեսոր և Նյու Մեքսիկոյի համալսարանի Ներքին բժշկության բաժանմունքի թարգմանչական ինֆորմատիկայի բաժնի ղեկավար: «Այս ուսումնասիրությունը ուշադրություն է գրավում այդ իրավիճակի վրա: Մենք հույս ունենք խրախուսել գիտնականներին և ֆինանսավորողներին բացահայտել անհայտը»:

Oprea-ն ղեկավարել է IDG Գիտելիքի կառավարման կենտրոնի հետազոտողների թիմը՝ գենոմային, պրոտեոմիկ, քիմիական և հիվանդությունների հետ կապված տվյալների լայն շրջանակի սպառիչ վերանայման համար՝ մարդկային սպիտակուցների զարգացման թիրախային մակարդակին (TDL) հետևելու համար:

Հետազոտողները առաջարկել են խմբավորել մարդկային սպիտակուցները չորս TDL կատեգորիաներից մեկի մեջ.

• T_թարթել («կլինիկական» համար) ներկայացնում է ամենաշատ ուսումնասիրված սպիտակուցները, որոնք հայտնի փոխազդեցություններ ունեն հաստատված դեղամիջոցների հետ և որոնց համար գոյություն ունի գործողության բացահայտված մեխանիզմ: Դրանք ներկայացնում են մարդու պրոտեոմի ընդամենը 3 տոկոսը:
• T_chem («քիմիական» համար) ներառում է սպիտակուցներ, որոնք, ինչպես հայտնի է, կապվում են համեմատաբար բարձր հզորությամբ փոքր մոլեկուլների հետ: Այս խմբին բաժին է ընկնում պրոտեոմի 6 տոկոսը:
• T_bio (կենսաբանություն) վերաբերում է սպիտակուցներին, որոնց համար առկա են հիվանդության արդիականության փորձարարական ապացույցներ, և դրանց կառուցվածքի և գործառույթի վերաբերյալ որոշակի պատկերացումներ, բայց որոնք ամբողջությամբ չեն մշակվել որպես դեղամիջոցի թիրախ: Այս կատեգորիային է պատկանում պրոտեոմի մոտ 53 տոկոսը։
• T_մութ (նկատի ունենալով «մութ» գենոմը») ներառում է բոլոր սպիտակուցները, որոնք չեն համապատասխանում որևէ այլ կատեգորիայի ընդգրկման չափանիշներին։ առկա են զոնդերը», - ասում են հեղինակները: «Ոմանք ներկայացնում են չուսումնասիրված հնարավորություններ դեղորայքի ենթակա մարդու գենոմում»: Այս սպիտակուցները կազմում են պրոտեոմի 38 տոկոսը:

Հեղինակները նշում են, որ մութ գենոմի ուսումնասիրության ֆինանսավորումը սակավ է եղել, մասամբ այն պատճառով, որ հետազոտությունները հաճախ հիմնված են «արհեստական ​​տարբերակումների» վրա, որոնցում խնդիրները տարանջատվում են ըստ օրգանների կամ հիվանդությունների: «Այս տարբերությունն իր բնույթով խզվում է, քանի որ մենք, ամենայն հավանականությամբ, կդիտարկենք փոխազդեցությունը նույն գեների և ուղիների միջև՝ անկախ օրգանից, թեև համատեքստին հատուկ ձևով»:

Նրանց առաջարկած դասակարգման սխեման «ապահովում է մարդու թիրախները բաժանելու հարմար միջոց, որն ընդգծում է գիտության և դեղերի հայտնաբերման ջանքերի կենտրոնացումը (կամ դրա բացակայությունը) տարբեր թիրախների վրա»:

Օպրեան ասաց, որ այն փաստը, որ դեղամիջոցների թիրախները, որոնց համար ներկայումս հայտնի են փոքր մոլեկուլները, ներկայացնում են մարդու պրոտեոմի միայն 10 տոկոսը, «ընդգծում է այն աստիճանը, որով մենք լիովին չենք հասկանում մարդու կենսաբանությունը: Շատ ավելի շատ աշխատանք կա անելու:

Նախապատմություն.

Գիտելիքների կառավարման կենտրոնում ընդգրկված են NIH ազգային կենտրոնի, Նյու Մեքսիկոյի համալսարանի, Մայամիի համալսարանի, Կոպենհագենի համալսարանի, Եվրոպական բիոինֆորմատիկայի ինստիտուտի և Սինա լեռան Icahn բժշկության դպրոցի հետազոտողներ: Այս աշխատության մյուս համագործակիցներն են Յեյլի համալսարանից, Հյուսիսային Կարոլինայի համալսարանից, Կալիֆորնիայի համալսարանից, Սան Ֆրանցիսկոյից, Բեյլորի բժշկական քոլեջից, Ցյուրիխի համալսարանից, ինչպես նաև IQVIA-ից և AstraZeneca-ից: