Գենոմային դետեկտիվներ

ՄԱԿ -ի գիտնականներն ուսումնասիրում են կորոնավիրուսային տատանումները ՝ հետագայի մասին հուշումների համար

Ինչպես նոր կորոնավիրուսը - գիտնականներին հայտնի է որպես SARS-CoV-2- վերարտադրվում է, տատանումները հայտնվում են նրա գենետիկական կոդի մեջ: Changesամանակի ընթացքում կուտակվելով ՝ այս փոփոխությունները նման են մատնահետքերի ՝ թողնելով հուշումներ, որոնք ցույց են տալիս, թե որտեղ է եղել վիրուսը և ուր կարող է այն տանել:

Նյու Մեքսիկայի համալսարանի գիտնականներ Դարել Լ. Դինվիդի, բ.գ.թ. և Դարիլ Դոմմանը, բ.գ.թ. խաղալով գենոմային հետախույզների դերը, որոնք փորձում են ճեղքել գործը:

Նրանք մաս են կազմում հետազոտական ​​համալսարանների և հանրային առողջապահության վարչությունների նորաստեղծ ազգային կոնսորցիումի, որը ձգտում է հետևել հիվանդությանը: Dubրագիրը, որը կոչվում է SARS-CoV-2 SPHERES, հովանավորվում է Emerարգացող և կենդանաբանական ինֆեկցիոն հիվանդությունների ազգային կենտրոնի կողմից (Հիվանդությունների վերահսկման և կանխարգելման կենտրոնների մասնաճյուղ) ՝ որպես վիրուսի մասին կարևոր տեղեկությունների համախմբման միջոց:

ՄԱԿ -ի մանկաբուժության ամբիոնի դոցենտ Դինվիդիին վերջին մի քանի շաբաթների ընթացքում իր մոլեկուլային գենոմիկայի լաբորատորիայում հաջորդականացնում է հարյուրավոր կորոնավիրուսային նմուշներ, որոնք ստացվել են Նյու Մեքսիկայի առողջապահության դեպարտամենտից և Վայոմինգի հանրային առողջության լաբորատորիայից:

«Վերջերս մենք ավարտեցինք Նյու Մեքսիկոյից առաջին 48 գենոմները», - ասում է նա: «Կա վկայում, որ նահանգում առաջին վարակների մեծամասնությունը կապված են եղել ճանապարհորդության հետ ամբողջ աշխարհից»:

Դինվիդիին վերլուծության մեջ համագործակցում էր ներքին բժշկության ամբիոնի ասիստենտ Դոմմանի, բ.գ.թ. «Նա անում է շատերը, ինչ մենք անվանում ենք գենոմային համաճարակաբանություն», - ասում է Դինվիդիին ՝ հավելելով, որ Դոմանն ամբողջ աշխարհում խոլերայի բռնկումներին հետևելու փորձ ունի: «Մենք օգտագործում ենք շատ նմանատիպ մեթոդներ ՝ SARS-CoV-2- ը հետաքննելու համար»:

Նոր կորոնավիրուսային գենոմը կոդավորված է RNA կոչվող մոլեկուլի տողերում: Շղթայի նուկլեոտիդների հաջորդականության աննշան փոփոխությունները տեղեկատվություն են տալիս այն մասին, թե որքան սերտորեն է կապված վիրուսային նմուշը մյուսին:

Դինվիդիի և Դոմմանի նման գիտնականները քրտնաջան աշխատում են այս նմուշների գրադարան կառուցել ՝ վիրուսային տոհմածառ ստեղծելու համար:

Նյու Մեքսիկոյում հավաքված նմուշների նախնական վերլուծությունը հուշում է, որ նահանգում եղել են վիրուսի բազմաթիվ ներմուծումներ, ինչը համահունչ է արտասահման կամ ներսում ճանապարհորդած մարդկանց դեպքերի վաղ զեկույցներին:

«Մենք կարող ենք նաև ասել վաղ գենոմային անալիզից, որ նմուշների մեծ մասն ավելի նման է Եվրոպայից կամ Նյու Յորքից դուրս եկող շտամներին», - ասում է նա: «Մենք շատերին չենք տեսնում, որոնք սերտորեն կապված են Չինաստանի հետ»:

Վիրուսների վերարտադրության գենոմային տատանումները բնական գործընթաց են: «SARS-CoV-2 S- ի համար գենոմային փոփոխությունների մակարդակը բավականին կայուն է եղել»,-ասում է Դինվիդիին: «Մենք գիտենք, թե որքան արագ է այն փոխվում: Այդ տեղեկատվության հիման վրա մենք կարող ենք կանխատեսումներ անել, թե որքան հետ են գնացել տարբեր նմուշներ»:

Վիրուսային նմուշները վերցված են քթի շվաբրերից, որոնք հավաքվել են կորոնավիրուսային վարակի դրական փորձարկված հիվանդներից: Դրանք վարվում են կենսաանվտանգության ընթացակարգերի միջոցով և անգործության են մատնվում, որպեսզի դրանք այլևս վարակիչ չլինեն, ասում է Դինվիդիին: